海洋微生物多樣性

海洋微生物包含了病毒、原核生物與真核生物等。
研究方向主要有16S、18S或是eDNA的擴增子定序及基因體的解序等。
海洋是生命的起源的地方，因此研究海洋微生物的演化機制相當重要，此外，海洋微生物的種類組成也常被當作環境指標來使用。
海洋微生物的基因體中有很多未知功能的基因，了解這些基因的功能可以對生地化循環和活性化合物開發有所幫助。

基因體解序與分析

針對樣品製備的方法研發和優化，利用不同解序平台，對臺灣周遭海域特殊或是重要的海洋生物種類進行基因體解序和分析。

生物資訊分析方法和服務

開發、建立各式分析方法，包括序列品質分析、序列和基因體組裝、基因預測、比較基因體學、建構親緣關係樹、蛋白質結構預測、統計分析等。 並且舉辦工作坊推廣分析方法、邀請專業學者或是廠商專員分享數據分析經驗，同時也提供分析和技術診斷服務。

目前資訊設備

(建置中)