Ocean-M：一個整合全球尺度海洋微生物多樣性、功能和生態相互作用的多體學資料庫
摘要
多體學分析顯著增進了我們對複雜海洋微生物群聚及其相互作用的理解。儘管近年來大規模海洋薈萃分析取得了顯著進展，但有效整合和獲取這些多樣化的資料集仍面臨挑戰。為了解決這個問題，我們推出了 Ocean-M（http://om.qnlm.ac），這是一個全面且公開的海洋微生物多體學資料整合、分析和視覺化平台。 Ocean-M 系統地展示了 54,083 個高品質的全基因體組裝基因體，包括基因體組裝統計、基因體聚類、基因註釋以及用於全球尺度分類分析的互動式工具。該平台還整合了微生物群聚網絡、宿主-微生物組相互作用以及環境 DNA 數據集，從而構建了一個用於研究微生物相互作用和生態系統功能的綜合生態框架。此外，Ocean-M 能夠大規模挖掘具有重要生態和生物技術價值的基因，其精心整理的目錄包含 151,798 個生物合成基因簇、52,699 個抗生素抗藥性基因以及數百萬個碳水化合物活性酶和塑膠活性酶。透過將多組學數據與環境元數據相結合，Ocean-M 為推進海洋微生物生態學、全球生物地理學和功能基因發現提供了寶貴的資源。
多體學分析顯著增進了我們對複雜海洋微生物群聚及其相互作用的理解。儘管近年來大規模海洋薈萃分析取得了顯著進展，但有效整合和獲取這些多樣化的資料集仍面臨挑戰。為了解決這個問題，我們推出了 Ocean-M（http://om.qnlm.ac），這是一個全面且公開的海洋微生物多體學資料整合、分析和視覺化平台。 Ocean-M 系統地展示了 54,083 個高品質的全基因體組裝基因體，包括基因體組裝統計、基因體聚類、基因註釋以及用於全球尺度分類分析的互動式工具。該平台還整合了微生物群聚網絡、宿主-微生物組相互作用以及環境 DNA 數據集，從而構建了一個用於研究微生物相互作用和生態系統功能的綜合生態框架。此外，Ocean-M 能夠大規模挖掘具有重要生態和生物技術價值的基因，其精心整理的目錄包含 151,798 個生物合成基因簇、52,699 個抗生素抗藥性基因以及數百萬個碳水化合物活性酶和塑膠活性酶。透過將多組學數據與環境元數據相結合，Ocean-M 為推進海洋微生物生態學、全球生物地理學和功能基因發現提供了寶貴的資源。
